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Screening for potential pain genes in breast cancer and lung adenocarcinoma using bioinformatics
Author(s): 
Pages: 180-185
Year: Issue:  3
Journal: Chinese Journal of Pain Medicine

Keyword:  骨癌痛乳腺癌肺腺癌生物信息学;
Abstract: 目的:通过乳腺癌和肺腺癌表达数据分析,筛选出骨癌痛潜在的致痛基因.方法:采用生物信息学技术分析TCGA数据库中乳腺癌和肺腺癌的基因表达数据,并通过与人类分泌组蛋白基因比对,获得乳腺癌和肺腺癌中表达趋势一致的分泌组蛋白差异基因.随后通过KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析这些差异基因的所在通路.结果:和正常样本相比,乳腺癌样本中有1422个基因表达上调,2124个基因表达下调;肺腺癌中1106个基因表达上调,3133个基因表达下调.其中,86个分泌组蛋白对应基因在乳腺癌和肺腺癌中一致上调,而244个分泌组蛋白对应基因在乳腺癌和肺腺癌中一致下调.对这330个差异基因进行KEGG富集分析,发现了细胞因子-细胞因子受体相互作用等20条通路具有显著差异.随后,通过文献回顾发现细胞因子CXCL、IL-6及TNF-α等与骨癌痛的发生有直接的关系.本研究中发现的基质金属蛋白酶家族多个成员表达明显上调,这些蛋白对于肿瘤的骨转移以及骨质破坏和重塑发挥着重要作用,间接参与了骨癌痛的发生.结论:通过肿瘤表达数据挖掘,本研究筛选出了数百个差异表达基因,其中多个基因已有报道参与了骨癌痛的发生和维持,其余可能是潜在的致痛基因.
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